El reactivo de PCR en tiempo real podría usarse en la estación de preparación de muestras de lluvia. Sin embargo, el protocolo de ciclo térmico debe ajustarse debido a la necesidad de un paso de desnaturalización inicial en DPCR. Se deben optimizar otros parámetros, por ejemplo, la temperatura de recocido, el tiempo de recocido o el número de ciclos, para garantizar un rendimiento óptimo del ensayo. Además, la concentración para cebadores y sondas para funcionar de manera óptima en DPCR podría ser diferente y, por lo tanto, requiere optimización. No todos los reactivos de Taqman en los reactivos QPCR son compatibles con el aceite de generación de gotas de PCR digital. Por lo tanto, algunos reactivos de QPCR pueden no funcionar o no pueden generar ninguna señal en la estación de preparación de muestras de lluvia.
